Syphon Filter: The Omega Strain

Il gioco inizia a Carthage, Michigan, quando Imani Gray e quattro reclute IPCA vengono inviati per localizzare Lawrence Mujari ed eliminare la minaccia…

Il gioco inizia a Carthage, Michigan, quando Imani Gray e quattro reclute IPCA vengono inviati per localizzare Lawrence Mujari ed eliminare la minaccia dell'Esercito Anarchico di Liberazione Francese (ALA), mentre Gabriel Logan e Lian Xing indagano sull'Uganda, con Gary Stoneman che indaga sull'Italia. Gli agenti dell'IPCA sventano i piani dell'ALA. Mujari è guarito e sotto cure mediche. Nel frattempo, Stone scopre che Cosa Nostra vuole recuperare il virus per usarlo come strumento nelle guerre di mafia. Così Stone è andato in missione a Pescara per assassinare il capo della mafia, Dimitri Alexoupolos. L'assassinio di Dimitri ha impedito a una famiglia mafiosa di ottenere l'accesso a Syphon Filter.